强直性脊柱炎是有明显家族集聚发病趋势的。实验发现强直性脊柱炎患者90%为HLA-B27阴性，而在HLA-B27阳性人群中发现强直性脊柱炎的可能性为2%，但级HLA-B27阳性亲属中，发病的危险性达20%。
 
    家系研究发现，在AS患者一级亲属中AS患病率升高到11-21%。对孪生人群的研究更支持这种遗传易感性。单卵孪生对AS患病的一致性超过50%。
 
    总之强直性脊柱炎比类风湿性关节炎有着更强的家属遗传倾向，不少作者在临床上看过兄弟或父子同时患病的情况。尽管遗传因素的重要性已被公认，但其具体的遗传方式仍不清楚。有人认为本病是由一个常染色体显性因素所产生的。也有人认为强直性脊柱炎可能是由于基因因素和环境因素的综合作用的多因素遗传。